Can I eat food from (glass) items that were not toiveld, that came in a Mishloach Monas?

Yes, it’s okay to eat after the fact, but take it out right away and do not eat it directly from the keli.

Sources:

עיין ירושלמי ע”ז פ”ה הט״ו, והוא דעת כל הפוסקים, זולת האו”ז סימן רצג שנסתפק בזה. וכן הוא להלכה ברמ”א יו״ד סימן קכ סעיף טז. ועיין בערוה”ש שם יז שאפילו השתמשו בחמין. ופשוט. ועיין שו״ת אג”מ יו״ד ח”ב סימן מא ד״ה אבל בעצם, שאפילו במזיד לא נאסר מדין קנס.