Do I have to ensure that the pretzels that are used by a kosher store in their pretzel breaded chicken cutlets are Pas Yisroel?
Yes, as pretzels are subject to the laws of Pas Yisroel.
See here.
Sources:
חידושי חת”ס יו”ד קיב, יב. דרכי תשובה קיב, מט. ערוך השולחן קיב, לא. וראה אצלינו בהלכה יומית אות תרצד.
#6491