Is רבון העולמים (the one right before המפיל) said every night by קריאת שמע שעל המטה, even on Shabbos ?

Yes.

Sources:

שבסידור לא נזכר שום חילוק.

וכן נדפס במחזור לר״ה. אלא שבדפוסים הקודמים לא נמצא רק ביוהכ״פ, דליכא חשש הזכרת חטא.

וכן נמסר בשם הרש״ח ע״ה קסלמן. והטעם, שאין מזכירים שם להדיא חטאים ועוונות. והבקשה שתטהר אותם מכל טומאה וחלאה וכו׳ – בגדר סיפור דברים.

#51047